API de pagamento é a aplicação que conecta sistemas (e-commerce, on-line, ERPs e etc) a uma transação financeira processada por bancos, adquirentes e gateways de pagamento.

API (Application Programming Interface) é um conjunto de rotinas e padrões estabelecidos por um software para a utilização das suas funcionalidades por aplicativos que não pretendem envolver-se em detalhes da implementação do software, mas apenas usar seus serviços. Wikipedia